所得税的计算步骤
复兴特别所得税（復興特別所得税）为所得税额的2.1%，征收至2037年。根据2026年度税制改革，从2027年度所得起新设1%的防卫特别所得税，复兴特别所得税降至1.1%（征收期延长至2047年），合计2.1%保持不变。
缴纳的社会保险费可全额扣除。因此即使年薪相同，社会保险费越多，应税所得越少。
工资年收入 − 工资所得扣除 = 工资所得 工资所得 − 所得扣除（社会保险费、基础扣除、抚养扣除等）= 应税所得（舍去1,000日元以下） 应税所得 × 税率 − 速算扣除额 = 所得税 所得税 × 102.1% = 所得税 + 复兴特别所得税（实际缴纳额）
2026年度工资所得扣除与基础扣除
2025年和2026年连续两年大幅提高了扣除额。以下为2026年度（2026年1至12月所得）的标准。
- 基础扣除（所得税）: 合计所得489万日元以下为104万日元，489万至655万日元为67万日元，655万至2,350万日元为62万日元。本则由58万日元提高到62万日元，2026、2027年度对中低收入者另加特例。超过2,350万日元后逐级减少，超过2,500万日元为零。
- 178万日元之墙: 工资所得扣除最低74万日元 + 基础扣除104万日元 = 178万日元。只有工资收入的人年收入178万日元以内不缴所得税（2024年度以前为103万日元，2025年度为160万日元）。
- 住民税另行计算: 住民税的基础扣除为43万日元，工资所得扣除最低74万日元从2027年度（2026年所得）住民税起适用。因此即使所得税为零，也可能需要缴纳住民税。
| 工资年收入 | 工资所得扣除（2026年度） |
|---|---|
| 约220万日元以下 | 74万日元（最低保障额） |
| 约220万至360万日元 | 年收入 × 30% + 8万日元 |
| 360万至660万日元 | 年收入 × 20% + 44万日元 |
| 660万至850万日元 | 年收入 × 10% + 110万日元 |
| 超过850万日元 | 195万日元（上限） |
最低保障额74万日元由本则69万日元加上仅限2026、2027年度的特例5万日元构成（2025年度为65万日元）。第一档的分界为计算近似值，请以国税厅速查表为准。
所得税税率表与计算示例
同一人的住民税（2027年度）按基础扣除43万日元计算：应税所得241万日元 × 10% − 调整扣除2,500日元 + 均等割5,000日元 = 约24.4万日元。日本上班族住民税多于所得税的情况很常见。
例）2026年度，年收入500万日元，单身，社会保险费约72万日元（假设） 工资所得 500万 −（500万 × 20% + 44万）= 356万日元 应税所得 356万 − 72万 − 基础扣除104万 = 180万日元 所得税 180万 × 5% = 9万日元 → 含复兴特别所得税91,890日元
| 应税所得 | 税率 | 速算扣除额 |
|---|---|---|
| 195万日元以下 | 5% | 0日元 |
| 超过195万至330万日元 | 10% | 97,500日元 |
| 超过330万至695万日元 | 20% | 427,500日元 |
| 超过695万至900万日元 | 23% | 636,000日元 |
| 超过900万至1,800万日元 | 33% | 1,536,000日元 |
| 超过1,800万至4,000万日元 | 40% | 2,796,000日元 |
| 超过4,000万日元 | 45% | 4,796,000日元 |
源泉征收与年末调整
- 源泉征收（源泉徴収）: 公司每月按源泉征收税额表从工资中预扣所得税。抚养亲属通过年初提交的“抚养扣除等申报书”（扶養控除等申告書）反映。
- 年末调整（年末調整）: 12月（或当年最后一次发薪）重新计算全年税额，多扣的退还，少扣的补征。人寿保险费、地震保险费扣除、配偶扣除、iDeCo缴费以及第二年起的住房贷款扣除也在此处理。
- 2026年修改部分的结算: 2026年1至11月的源泉征收按修改前标准的税额表计算，扣除增加的效果在2026年度年末调整中一并反映（依据国税厅说明，各公司的处理时间请确认）。
- 源泉征收票（源泉徴収票）: 记载年末调整结果的文件，次年1月底前领取。上面有年收入、扣除额和税额，用于贷款审查、确定申报、在留资格更新等。离职时在离职后1个月内领取。
需要确定申报的情况
上班族原则上通过年末调整完成纳税，但符合以下情况时，须在次年2月16日至3月15日进行确定申报（確定申告）。只为退税的申报可在次年1月起5年内进行。
申报书可在国税厅“确定申报书等作成角”（確定申告書等作成コーナー）制作，并通过e-Tax提交。有个人编号卡（マイナンバーカード）的话，可通过Mynaportal联动自动导入部分源泉征收票、医疗费通知和故乡纳税捐赠数据。
- 工资年收入超过2,000万日元: 不属于年末调整对象，必须申报。
- 副业等工资以外所得超过20万日元: 副业收入扣除经费后的所得每年超过20万日元时有申报义务。即使在20万日元以下，住民税也须另行申报。
- 医疗费扣除: 家庭合计医疗费（扣除保险赔付等）每年超过10万日元（所得未满200万日元时为所得的5%），超出部分最多可扣除200万日元。与自我药疗税制只能二选一。
- 住房贷款扣除第一年: 第一年需要确定申报，第二年起可通过年末调整办理。
- 故乡纳税（ふるさと納税）: 捐赠对象在5个以内且无需确定申报时，可通过一站式特例（次年1月10日前提交申请书）免申报从住民税中扣除。超过6个，或因医疗费扣除等本来就要申报时，特例申请会失效，须在申报书中填写全部捐赠。
- 年中离职后未再就业: 因未经过年末调整，申报后往往能退回部分已预扣的税款。
住民税按上一年收入晚一年征收
- 机制: 住民税由1月1日所在的市区町村按上一年所得征收。所得割为应税所得的10%（道府县民税4% + 市町村民税6%），均等割每年4,000日元（道府县民税1,000日元 + 市町村民税3,000日元，部分地方另有加征），另与其一并征收国税森林环境税1,000日元，定额部分合计每年约5,000日元。
- 特别征收: 上班族从6月到次年5月分12次从工资中扣除。因此涨薪后，住民税要到次年6月才会增加。
- 普通征收: 自营业者和退休人员凭纳税通知书缴纳，通常分6月、8月、10月和次年1月4次。
- 职场新人: 第一年没有上一年所得，因此不缴住民税，从第二年6月开始扣除。这就是“第二年到手工资变少”的原因。
- 离职时: 1至5月离职时，剩余住民税原则上从最后一次工资中一次性扣除；6至12月离职时，可选择一次性扣除或改为普通征收。
离开日本时
出境成为非居民后，需要提前办妥税务手续。
- 所得税: 公司在出境前进行年末调整。如因副业所得等需要确定申报，应在出境前申报，或指定纳税管理人（納税管理人）并向税务署提交申请，由其代为申报和缴纳。
- 住民税: 如果当年1月1日住在日本，即使出境也须缴纳当年度住民税（上一年所得部分）。可在出境前一次性缴清，或向市区町村申报纳税管理人。
- 出境后领取的款项: 出境后从日本领取的工资、退职金等可能按非居民课税（原则上源泉征收20.42%）。也请一并确认移居国的税制和税收协定。
常见问题
已经做了年末调整，还能再做确定申报吗？
可以。要追加医疗费扣除、捐赠扣除等年末调整无法处理的扣除时，可进行确定申报。照抄源泉征收票内容，再加上追加的扣除即可。
副业所得在20万日元以下，什么都不用做吗？
没有所得税确定申报义务，但住民税无论金额多少都须向市区町村申报。另外，如果因医疗费扣除等进行确定申报，副业所得也要一并填写。
故乡纳税最多能扣除多少？
除自付2,000日元外全额扣除的上限因收入和家庭构成而异。可通过总务省故乡纳税门户网站的参考表等确认上限，超过上限的部分相当于普通捐赠。
年收入超过178万日元会吃亏吗？
所得税只对超出部分征收，到手收入不会倒挂减少。但住民税标准、社会保险加入条件（每周20小时等）和配偶相关扣除各自独立，需要从整个家庭来考虑。